Ну, похоже, что решение состоит в том, чтобы просто слегка сместить максимальное значение.
Первоначально у меня было это:
<mx:verticalAxis>
<mx:LinearAxis id="count" maximum="6"/>
</mx:verticalAxis>
И верхняя линия сетки не будет отображаться черной (если я не установлю вес линии равным 2 или выше, и даже тогда она не будет выглядеть так же, как другие линии сетки).
Но, слегка изменив максимальное значение следующим образом:
<mx:verticalAxis>
<mx:LinearAxis id="count" maximum="6.01"/>
</mx:verticalAxis>
Делает верхнюю сетку видимой, как и должно быть. Не уверен, что это правильное или лучшее решение, но оно решает проблему.