Вам нужно будет найти параметр Always recreate database в свойствах проекта базы данных -> Развернуть -> Файл конфигурации развертывания -> Редактировать диалог.
Вам также может пригодиться другой параметр «Удалить объекты, которые существуют в целевой базе данных, но отсутствуют в схеме».