У меня была такая же проблема.
Проект A, на который ссылается Проект B.
Проект C ссылался на Проект D, который ссылался на Проект B.
Это привело к тому, что у проекта C была ссылка на проект B.
Я избавился от Project D и очистил Project C (в коде),
но ссылка на проект B осталась, я думаю, в виде двоичной ссылки, указывающей на папку bin проекта D.
Я обновил Проект B в визуальной студии.
Когда я запустил запуск Project C, он выдал эту ошибку.
Чтобы исправить, я вошел в ссылку для Project C и удалил неиспользуемые ссылки.
Кстати, на ваш реальный вопрос - как узнать, где живет оскорбительная dll, - проще ответить так:
1. Зайдите в проводник (инструкции для окна 7 здесь) и выполните поиск по всей папке с кодом для .dll.
2. Добавьте столбец в проводнике для FileVersion и выполните сортировку по этому столбцу. Voila!