Не верно, Weka's J48 (вариант C4.5 ) поддерживает числовые атрибуты. В этом основное отличие алгоритма ID3 (среди прочего)
EDIT:
Похоже, вы имели в виду числовой выходной класс, а не числовые входные атрибуты.
В этом случае вы ищете деревья моделей / регрессий . У Weka есть реализация алгоритма M5 R. Куинлан (тот же самый парень, который первоначально представил алгоритм C4.5 для дискретных классов) в weka.classifiers.trees.M5P . Алгоритм аналогичен обычному C4.5, за исключением того, что он использует стандартное отклонение вместо энтропии, также листовые узлы содержат модель регрессии (или просто среднее значение).