Используйте команду NET:
Чтобы запустить службу, введите: net startservice
Чтобы остановить службу, введите: net stopservice
Чтобы приостановить службу, введите: net pauseservice
Чтобы возобновить обслуживание, введите: net continueservice
См. Эту статью Microsoft о дополнительных деталях:
Статья Microsoft
Кроме того, я бы посмотрел журналы событий Windows (приложения и системы), чтобы узнать, почему SQLServer останавливается в первую очередь.