Эран намекнул в правильном направлении.В качестве примера я использую файл ant.library.dir.
<project name="util">
<property name="lib.dir" value="${ant.library.dir}"/>
<target name="gen-property-file" description="">
<path id="lib.path.id">
<fileset dir="${lib.dir}">
<include name="*.jar"/>
</fileset>
</path>
<pathconvert pathsep="${line.separator}wrapper.java.classpath.Number="
property="echo.path.compile"
refid="lib.path.id">
</pathconvert>
<echo file="my.properties">wrapper.java.classpath.Number=${echo.path.compile}</echo>
</target>
Этот фрагмент кода обрабатывает файл my.properties:
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-antlr.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-apache-bcel.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-apache-bsf.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-apache-log4j.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-apache-oro.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32\eclipse\plugins\org.apache.ant_1.7.1.v20100518-1145\lib\ant-apache-regexp.jar
wrapper.java.classpath.Number=D:\Programme\eclipse-rcp-helios-SR1-win32
...
Вы можете заменить .Number и Basepath вручную или сценарием.