Если вас интересует только резервное копирование данных, и вам не нужно выводить их как SQL, вы можете поместить выбранные операторы SQL в файл и выполнить их с помощью команды mysql, перенаправив их в файл, например это:
mysql my_database < queries.sql > backup.txt
Есть несколько дополнительных опций, касающихся разделителей и тому подобного. Посетите справочные страницы mysql.