Не видя ни одного вашего кода, я собираюсь сделать дикое предположение (но это то, что я видел довольно много) ...
Вы пытаетесь взаимодействовать со страницей хоста внутри iFrame (а содержимое в iFrame поступает из другого домена)? Если это так, это считается проблемой безопасности межсайтовых сценариев, и большинство современных браузеров блокируют вызовы.
Проверьте / включите ошибки Javascript (или посмотрите на консоль Javascript, если она есть в вашем браузере) и посмотрите, получаете ли вы какие-либо конкретные сообщения об ошибках.