Это изменит ссылку, поэтому href будет таким же.
$("#popup").attr('href',window.location.href);
например,
<a id="popup" href="">popup</a>
становится
<a id="popup" href="yourcurrenturl">popup</a>
РЕДАКТИРОВАТЬ:
Чтобы дать вам немного вдохновения для других методов всплывающих окон (простите, если это, если этот код не работает, я просто быстро собрался вместе)
HTML
<a href="http://www.developertipoftheday.com" rel="popup" target="alexsite">open alex site in popup</a>
JavaScript
$("a[rel = 'popup']").click(function (event) {
var popupWindow= window.open($(this).attr("href"), $(this).attr("target"), "status=true,toolbar=false,menubar=false,location=false,width=1018,height=792")
if (popupWindow=== null) {
alert("A messasge to inform the user, that the popup has been blocked");
}
});