Вы можете использовать xdotool для автоматизации. Установить в Ubuntu с
sudo aptitude install xdotool
Затем вы можете искать окна и отправлять ключи или события мыши, см. man xdotool
для полной документации. Во время разработки я использую следующий скрипт на Ubuntu 10.04 LTS:
WID=`xdotool search --name "Mozilla Firefox" | head -1`
xdotool windowactivate $WID
xdotool key F5
См. Также сайт проекта xdotool
и мой полный пост в блоге .