Если вы удаляете из командной строки, вы можете использовать
msiexec /x c:\Example.msi PROPERTY=VALUE
для инициализации ваших свойств.
Кроме того, вы можете сохранить свойства в реестре и использовать что-то вроде:
<Property Id="PROPNAME">
<RegistrySearch Id="PropNameRegistry" Type="raw" Root="HKLM" Key="Software\MyProduct\MyKey\PropValue" Name="MyPropName" />
</Property>
чтобы получить их.