Вы на неправильном пути.Файл - это только то, что написано непосредственно в файловой системе.Файл внутри jar не является файлом с точки зрения API Java.
Чтобы прочитать этот файл, вам нужно проанализировать JAR с помощью JarInputStream или ZipInputStream, перейти к интересной записи и прочитать из входного потока.Это не сложно сделать, но вы должны написать несколько строк кода.
Другой подход - использование пакета VFS от jakarta.org.Он предоставляет вам единое представление об элементах различных файловых систем, ZIP, TAR и других форматов контейнеров.