К сожалению, здесь нет хорошего ответа. Вам просто нужно зайти и вручную изменить настройки поставщика управления версиями Visual Studio, прежде чем открывать проект. Это ограничение того, как работает эта конкретная система плагинов, и, вероятно, потребуется новая версия Visual Studio, чтобы конкретно решить эту проблему.
Это тот случай, когда visual studio лучше работает для корпоративного магазина со стандартизированными инструментами управления версиями, но не так хороша для подрядчика, работающего с несколькими клиентами с использованием множества технологий.