RDP - это собственный протокол, которым он обеспечивает совместное использование буфера обмена.
Из спецификации протокола удаленного рабочего стола :
Отображение буфера обмена
Пользователи могут удалять, копировать и вставлять текст и графику между приложениями, запущенными на локальном компьютере, и приложениями, запущенными в сеансе удаленного рабочего стола, а также между сеансами.
Вы также можете получить полную статью о протоколе RDP от MSDN здесь . PDF описывает протокол в терминах простого протокола, архив PDF предоставляет документы для отдельных сервисов, расположенных поверх него.