Возможно, потому что SurfaceViews просто «пробивают дыру в экране», как сказал один из разработчиков Android.Они немного особенные для того, чтобы быть сверхбыстрыми.
Я не знаю точно, что вы пытаетесь достичь, но, возможно, одним из решений будет изменение вашего кода GL для того, чтобы он исчез вГл. рисунок.