Я бы тщательно рассмотрел две вещи: виртуальные функции и исключения. Они влияют на ход программы сложным образом. GPU довольно просты в этом отношении, они даже не любят ветки.
Обратите внимание, что указатели на функции также сложны, и они есть в C. На самом деле у вас их будет больше: qsort() нужен указатель на функцию, а std::sort - нет.