Да, можно, но проблема в том, что практически невозможно различить Subclipse и Subversive в пользовательском интерфейсе.Поэтому, когда вы используете Team> Share для подключения к проекту, вы просто увидите две записи SVN в пользовательском интерфейсе.
Лучше всего просто выбрать один из них и использовать его для всех.