если вы читаете текстовый файл или любой другой текст, который вы можете:
char[] dele = { ' ', ',', '.', '\t', ';', '#', '!' };
List<string> allLinesText = File.ReadAllText(text file).Split(dele).ToList();
, тогда вы можете преобразовать стоп-слова в словарь и сохранить документ в списке, затем
foreach (KeyValuePair<string, string> word in StopWords)
{
if (list.contain(word.key))
list.RemovAll(s=>s==word.key);
}