Если вы хотите один выбор, используйте переключатели с группой переключателей.
Единственная причина, по которой вы хотите использовать флажки, - это если вы хотите отключить все варианты выбора (с помощью переключателей, когда вы нажимаете кнопку, всегда выбирается один).
Если вы все еще хотите использовать флажки, сделайте следующее:
onCheckBoxSelected(e:Event){
for each(checkbox:CheckBox in collectionOfCheckBoxes){
if(checkbox != e.currentTarget){
checkbox.selected=false;
}
}
}