Если вам не нужно сохранять файл как один файл и просто хотите воспроизвести его вместе, вы можете просто создать 2 MediaPlayers и воспроизводить их одновременно.Если вы действительно хотите создать новый файл, вам нужно прочитать о структуре файла WAV и перейти оттуда.