Вам потребуется использовать метод jQuery.noConflict, описанный в http://docs.jquery.com/Core/jQuery.noConflict.
Не точно, если версия 1.2.1 будет иметь его.
Просто прочитайте инструкции на этой странице, чтобы узнать, как их подключить.
Во-первых, вам нужно поставить jQuery перед другими библиотеками.
Обновление: добавлен код ниже, чтобы помочь вам применить исправление.
Если строка jQuery.noConflict () вызывает ошибку, возможно, вам придется попробовать более новую версию jQuery.
<script src="js/jquery-1.2.1.min.js" type="text/javascript"></script>
<script type="text/javascript"> jQuery.noConflict() </script>
<!-- lightwindow files -->
<script type="text/javascript" src="lightwindow/javascript/prototype.js"></script>
<script type="text/javascript" src="lightwindow/javascript/scriptaculous.js?load=effects"></script>
<script type="text/javascript" src="lightwindow/javascript/lightwindow.js"></script>
<link rel="stylesheet" href="lightwindow/css/lightwindow.css" type="text/css" media="screen" />
<!-- accordion scripts -->
<script src="js/menu.js" type="text/javascript"></script>
<script src="js/jquery.cookie.js" type="text/javascript"></script>
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/accordion.css" />
Кроме того, обратите внимание, что вам может понадобиться поменять часть кода с $ (...) на jQuery (...)
Со страницы документа jQuery:
там, где вы использовали $ ("div p"), теперь вы должны выполнить jQuery ("div p").