XOR биты вместе? Например. для MD5, биты 0-63, биты XOR 64-127, вуаля, 64 бита. Это даст вам более слабый хеш, проверьте, приемлемо ли это для вас.
(также, если ваша среда не ограничена крайне - например, встроенными устройствами - возникает вопрос "зачем вам нужно , чтобы сократить ее?")