Проект веб-приложения отличается от проекта веб-сайта. Я сомневаюсь, что вы можете достичь того, чего хотите, с помощью проекта веб-приложения. Вы можете проверить это сообщение:
Веб-сайт ASP.NET или веб-приложение ASP.NET?
Ресурсы, как правило, должны быть статическими. Это такие элементы, как изображения, строки и файлы, которые использует ваша программа и на которые можно положиться (и, следовательно, могут быть строго типизированы в случае файлов строк или RESX). Причина использования ресурсов состоит в том, чтобы просто связать их с вашими DLL, чтобы распределение и ссылки на ресурсы стало намного проще.
Возможность редактирования во время выполнения предполагает, что вы, возможно, захотите использовать настройки проекта или пользователя или, возможно, базу данных? Если вам нужно использовать файлы RESX, вам может понадобиться написать код для чтения / записи.