Евангелист от Apple, Инструменты разработчика, Майкл Джурвиц, много раз заявлял, что команда разработчиков инструментов знает о разочаровании людей из-за отсутствия системы постепенного обновления.
К сожалению, как бы они ни были осведомлены, с этим ничего не было сделано, пока инструменты разработчика были доступны.
И теперь, когда Xcode 4 доступен в Mac App Store, мне кажется, что получить систему инкрементального обновления еще менее вероятно (хотя это только предположение с моей стороны). Я говорю это потому, что Mac App Store, как и его аналог на iPhone, загружает новое приложение полностью, когда доступно обновление.
Боюсь, вы ничего не можете сделать, кроме как ждать загрузки.