Это не точный ответ, но некоторые важные замечания, которые я сделал из исследования FLV-файлов для бизнес-требований.
Большая часть аудио FLV кодируется в формате MP3, что означает, что вы можете извлечь его непосредственно из контейнера FLV. Если FLV был создан из записи с микрофона, аудио кодируется с помощью кодека Nellymoser Asao, который является собственностью компании (IIRC).
Я бы проверил libavcodec , который изначально обрабатывает FLV / MP3 / Nellymoser и должен позволить вам добраться до аудио.