Попробуйте следующее
require 'rubygems'
gem 'nokogiri'
Если вы работаете с какой-либо формой * nix, вы получили какие-либо ошибки при установке гема, в частности, ошибки, указывающие на то, что гем не был на пути. Это может произойти, если вы установили драгоценный камень как вы, а не как root, и у вас нет личной библиотеки драгоценных камней в вашем пути к самоцвету.
Если вы всегда устанавливаете свои драгоценные камни, используя
sudo gem install some_gem_name
тогда у вас не должно быть этой проблемы.