Вы должны иметь возможность установить плагины Eclipse для SVN (или любой другой SCM, который вы используете), а затем проверить проект. Если это не сработает, попробуйте импортировать его (Файл -> Импорт -> Существующие проекты в рабочую область). Если это не сработает, создайте новый проект Flex, указанный в базовом каталоге вашего проекта.