Можете ли вы запустить инструмент командной строки? (например, вы используете веб-сайт приложения НЕ (hta также должен работать))
Если это так, возможно, хорошим решением будет использование Crystal Reports (установите тип экспорта в PDF) в сочетании с бесплатным инструментом экспорта (поиск crexport в Google).
Также есть много компонентов экспорта PDF для .NET, может быть, достаточно написать собственное приложение для командной строки?