Отправка сложных данных с помощью механизма скелета / контента в Boost MPI - PullRequest
3 голосов
/ 15 ноября 2011

Кажется, что отправка сложных данных через механизм скелета / контента не работает.

Вот простой код, который показывает проблему:

#include <boost/mpi.hpp>
#include <boost/serialization/complex.hpp>
#include <boost/serialization/vector.hpp>
#include <iostream>
namespace mpi = boost::mpi;
using namespace std;

int main(int argc, char* argv[])
{
     mpi::environment env(argc, argv);
     mpi::communicator world;
     int NN=world.size();
     int myid=world.rank();

     if (myid == 0)
     {
         int N = 10;
         vector <complex<double> > l(N);
         for (int p=1; p!=NN; p++)
             {
             int taskid=1;
             world.send(p, 0, taskid);
             world.send(p, 1, mpi::skeleton(l));
         }
         mpi::content c = mpi::get_content(l);
             for (int n = 0; n!=l.size() ; n++)
         {
             l[n]=complex<double>(1.0,1.0);
         }
         for (int p=1; p!=NN; p++)
         {
                 world.send(p, 1, c);
         }
     }
     else if (myid == 2)
     {
         vector <complex<double> > l;
         mpi::content c;
         world.recv(0, 1, mpi::skeleton(l));
         c = mpi::get_content(l);
         world.recv(0, 1, c);
         for (int n=0; n!=l.size(); n++)
         {
                 cout << l[n] << " ";
         }
         cout << endl;
     }
} 

Записи вектора l на выходе не являются (1.0,1.0), но, кажется, они неинициализированы.Это происходит только в том случае, если используются сложные типы данных И механизм скелета / контента.

Кто-нибудь знает, если это проблема со сборкой или я что-то не так делаю?

Ответы [ 3 ]

3 голосов
/ 28 ноября 2011

Недавно я столкнулся с подобной проблемой с одним из моих классов, и после некоторого прохождения процедуры сериализации в отладчике, я думаю, я понял, что происходит.Проблема заключается в использовании временных операторов в операторах сериализации.В boost / serialization / complex.hpp функции сериализации выглядят следующим образом:

template<class Archive, class T>
inline void save(
    Archive & ar,
    std::complex< T > const & t,
    const unsigned int /* file_version */
){
    const T re = t.real();
    const T im = t.imag();
    ar << boost::serialization::make_nvp("real", re);
    ar << boost::serialization::make_nvp("imag", im);
}

template<class Archive, class T>
inline void load(
    Archive & ar,
    std::complex< T >& t,
    const unsigned int /* file_version */ 
){
    T re;
    T im;
    ar >> boost::serialization::make_nvp("real", re);
    ar >> boost::serialization::make_nvp("imag", im);
    t = std::complex< T >(re,im);
}

Обратите внимание, что сериализация выполняется через временные.Функциональность get_content работает путем создания типа данных MPI, который действительно является картой расположения содержимого в памяти.При получении сообщения MPI копирует данные непосредственно в эти местоположения, не вызывая операторов сериализации.Проблема состоит в том, что когда «save» использует временные значения, get_content () не будет получать местоположения фактических данных, но временных значений, поэтому полученные данные не будут помещены в правильное место.функциональность содержимого для работы, у меня сложилось впечатление, что функция сохранения (которую вызывает get_content ()) должна напрямую и только сериализовать элементы данных объекта.В этом случае это невозможно, потому что у него нет доступа к внутреннему представлению комплекса.Я думаю, что нужно написать операторы сериализации в качестве членов класса.

(Эти ограничения вообще не упоминаются в документации Boost :: MPI.)

0 голосов
/ 11 марта 2014
namespace boost { 
namespace mpi {
    template <>
    struct is_mpi_datatype< complex<double> > : mpl::true_ { };
} }

с помощью этого может решить проблему.Оптимизация в сериале Boost

0 голосов
/ 07 декабря 2011

Вот возможное решение проблемы:

Я написал собственную сериализацию для сложных типов:

#include <boost/mpi.hpp>
#include <boost/serialization/vector.hpp>
#include <iostream>
namespace mpi = boost::mpi;
using namespace std;

namespace boost
{
    namespace serialization
    {
        template<class Archive>
        void serialize(Archive & ar, complex<double> & g, const unsigned int version)
        {
            ar & g.real();
            ar & g.imag();
        }
    }
}

int main(int argc, char* argv[])
{
    mpi::environment env(argc, argv);
    mpi::communicator world;
    int NN=world.size();
    int myid=world.rank();

    if (myid == 0) 
    {
        int N = 10;
        vector <complex<double> > l(N);
        for (int p=1; p!=NN; p++)
        {
            world.send(p, 1, mpi::skeleton(l));
        }
        mpi::content c = mpi::get_content(l);
        for (int n = 0; n!=l.size() ; n++) 
        {
            l[n]=complex<double>(1.0,1.0);
        }
        for (int p=1; p!=NN; p++)
        {
            world.send(p, 1, c);
        }
    } 
    else 
    {
        vector <complex<double> > l;
        mpi::content c;
        world.recv(0, 1, mpi::skeleton(l));
        c = mpi::get_content(l);
        world.recv(0, 1, c);
        for (int n=0; n!=l.size(); n++)
        {
            cout << l[n] << " ";
        }
        cout << endl;
    }
}
...