MPI_ERR_TRUNCATE при отправке комплексного числа по MPI [MPI4py] - PullRequest
Новая
       30

MPI_ERR_TRUNCATE при отправке комплексного числа по MPI [MPI4py]

0 голосов
/ 22 мая 2018

Я пытаюсь отправить одно комплексное число, используя реализацию MPI (MPI4py) в Python от одного отправителя к одному получателю.Вот код: 

from mpi4py import MPI
import numpy as np

comm = MPI.COMM_WORLD

if comm.rank == 0:

    print("I am sender")

    a = np.matrix('5+1j')

    req = [None]
    #Send message with a predefined tag, like 15, to rank 1
    req = comm.Isend([a, MPI.COMPLEX], dest=1, tag=15)

    MPI.Request.Wait(req)

    print("Sender sent:  ")
    print(a[0])

else:

    print("I am receiver")

    A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

    print("point 1")

    #Receive message with tag 15 from rank 0
    rA = comm.Irecv(A, source=0, tag=15)

    rA.wait()

    print("Receiver received:  ")
    print(A)

Обратите внимание, что приведенный выше пример является упрощенной версией моей цели, которая заключается в отправке массива numpy (или матрицы numpy) множества сложных записей от одного отправителя.к нескольким получателям.Вот почему я использую неблокирующую отправку Comm::Isend() и получение Comm::Irecv() вместе с Request::Wait() в этом примере.Однако в общем случае у меня будет один Comm::Isend() на итерацию цикла for и Request::Waitall() для вектора запросов, по одному для каждого получателя в целом.

Для вышеуказанной программы созданные процессы MPI простодва, один отправитель и один получатель.Также моя установка MPI4py 3.0.0.и использует Python 2.7.14 и ядро ​​Open MPI 2.1.2.

Теперь программа вылетает на

rA.wait()

со следующей ошибкой

mpi4py.MPI.Exception: MPI_ERR_TRUNCATE: сообщение усечено

, что на основе оперативного поиска означает, что буфера получателя недостаточно для хранения полученных данных, то есть комплексного числа, ноЯ не понимаю почему.

1 Ответ

0 голосов
/ 22 мая 2018

Вот что происходит под капотом:

  • MPI_Isend(..., datatype=MPI_COMPLEX, ...)
  • MPI_Irecv(..., datatype=MPI_LONG, ...)

Таким образом, проблема заключается в том, как вы инициализировалиприемный буфер 

A = np.empty_like(np.matrix([[0]*(1) for i in range(1)]))

Возможные исправления 

A = np.empty(shape(1,1), dtype=complex)

или 

A = np.matrix('-1-1j')

, чтобы A определялось как матрица комплекса

...