Вы получаете те же ошибки, когда выполняете sudo kill -HUP nginx_pid?(выполните sudo ps aux | grep nginx, чтобы получить pid).
Это действительно очень странный набор ошибок, которые вы получаете.Возможно, у вас все еще есть сеанс, открытый для вашей базы данных, пока вы перезапускаете, вызывая проблемы с вашим пулом базы данных?Доступ к базе данных Rails обычно прерывистый, но я могу себе представить, что проблемы возникают, если у вас выполняется длительный запрос базы данных и вы пытаетесь перезапустить Rails.
Тот факт, что ошибки продолжают изменяться, заставит меня поверить, что ошибки связаны с доступом к ресурсам, а не с вашей конфигурацией.