EGit 1.2 и более ранние версии не выбирают автоматически неотслеживаемые файлы в диалоге фиксации.
Это поведение изменилось в версии 1.3, выход которой ожидается 24 февраля 2012 года.
Предпочтение было добавлено на страницу настроек Team> Git> Commit , чтобы включить этот параметр, чтобы файлы были автоматически выбраны.
Это было добавлено на основании отчета об ошибке здесь .