Файлы jar помещаются в целевой каталог Eclipse, то есть в каталог, который создается и заполняется Eclipse при создании веб-приложения. Поэтому, конечно, каждый раз, когда Eclipse развертывает веб-приложение, он очищает этот каталог и развертывает новую версию.
Вы должны поместить файл jar в дерево исходного проекта под WebContent/WEB-INF/lib
. Банки в этом каталоге будут автоматически включены в путь сборки веб-приложения и будут скопированы в целевой каталог WEB-INF / lib во время развертывания Eclipse.