Если вы имеете в виду транзакционные электронные письма, да
Если вы посмотрите сценарии установки в
app/code/core/Mage/Sales/sql/sales_setup/mysql4-upgrade
вы можете найти примеры операторов SQL, используемых для обновления существующих шаблонов.
mysql4-upgrade-0.6.2-0.7.0.php
mysql4-upgrade-0.7.2-0.7.3.php
mysql4-upgrade-0.8.3-0.8.4.php
и
app/code/core/Mage/Contacts/sql/contacts_setup/mysql14-upgrade
показывает операторы вставки и обновления SQL
mysql4-install-0.7.1.php
mysql4-upgrade-0.7.1-0.7.2.php