В плагинах eclipse номера версий взяты из заголовков OSGi в файле MANIFEST.MF. например:
Bundle-SymbolicName: org.eclipse.ui; singleton:=true
Bundle-Version: 3.7.0.qualifier
Мы устанавливаем версию major.minor.micro вручную в соответствии с рекомендациями API по управлению версиями, например http://wiki.eclipse.org/Version_Numbering
Когда PDE UI экспортирует этот плагин, или сборка PDE (или другой системы сборки) строит его, система сборки заменяет что-то полезное для токена «квалификатора» как в файле MANIFEST.MF, так и в самом имени jar.
Например, org.eclipse.ui_3.7.0.I20110526-0100.jar