ACPI:
Вам необходимо изучить и использовать интерфейс управления системой WMI - Windows. Вот несколько ресурсов, которые дадут вам подсказку, с чего начать:
Обратите внимание, что некоторые материнские платы не поддерживают изменения скорости вращения вентиляторов, и даже те, которые поддерживают, могут не отображать это в WMI. В лучшем случае вам все равно придется определить тип материнской платы и напрямую поговорить с контроллерами управления вентиляторами.
Нет ACPI:
Если вы не хотите использовать ACPI, вам придется написать собственный код для доступа к SMBUS на материнской плате, а затем управлять микросхемами контроллера вентилятора.
Проверьте монитор материнской платы программы, чтобы узнать, как начать работу. Это нетривиально, так как каждая материнская плата и биос разные.