Я сделал следующее:
1) Создал ~/.perldb
, которого раньше не было.
2) Добавил &parse_options("HistFile=$ENV{HOME}/.perldb.hist");
из ответа Мирода.
3) Добавил export PERLDB_OPTS=HistFile=$HOME/.perldb.history
в ~ / .bashrc из ответа mephinet.
4) Ран source .bashrc
5) Ран perl -d my program.pl
и получил это предупреждение / ошибку
perldb: Must not source insecure rcfile /home/ics/.perldb.
You or the superuser must be the owner, and it must not
be writable by anyone but its owner.
6) Я защитил ~/.perldb
с владельцем rw chmod 700 ~/.perldb
, и ошибка исчезла.