Используя Artifactory, вы можете создавать виртуальные репозитории , которые агрегируют «реальные» (локальные \ удаленные) репозитории и имеют один виртуальный репозиторий, объединяющий только репозитории плагинов, а другой - для агрегирования только стандартных библиотечных репозиториев.
Как вы уже догадались, если у вас должно быть сильное разделение между зависимостями плагина и lib из прокси-сервера удаленного репозитория, вам нужно создать дублирующее определение для каждого из них и добавить их в соответствующие виртуальные репозитории.
Как только эта настройка будет завершена, просто укажите URL-адреса виртуальных репозиториев в файле settings.xml \ pom.xml