Это правда, что установщик Windows не поддерживает создание / настройку параметров реестра во время удаления.Странно, не правда ли?
Я не знаю, какое значение реестра вы устанавливаете, но установка может быть упрощена (без пользовательских действий), если вы сможете изменить приложение, чтобы принять отсутствиезначение реестра как эквивалентное 0.