Единственный раз (кроме ошибки), когда инструмент слияния будет отключен, это когда вы находитесь в каком-либо статусе, отличном от конфликтного;то есть, вы увидите, что эта опция включена только тогда, когда статус «Конфликты».Статус отображается рядом с именем проекта в большинстве представлений, таких как Project Explorer и Synchronize.
Убедитесь, что вы слились с нужной ветвью, тогда, если слияние приведет к конфликтам, ваш проект перейдет в режим конфликтов,и инструмент слияния будет включен.