Сохраните файл с именем .pdbrc
в той же папке, что и файл скрипта. Введите информацию о точке останова:
b 3
b 5
b 70
b 89
Запустите ваш скрипт в pdb примерно так:
python -m pdb myscript.py
и pdb подберет и вставит ваши точки останова. К сожалению, при отладке он не сохранит изменения, которые вы внесли в них.
В качестве альтернативы вы можете указать их в первой строке
(Pdb) b 3;;b 5;;b 70;;b 89