Вы можете использовать внешнюю программу для фильтрации точек данных с одинаковыми данными в двух разных столбцах (здесь я проверял, есть ли в 75-м и 11-м столбцах одинаковые записи).
plot "t2" using 1:75 with linespoints title "crop 20",\
"t2" using 1:11 with linespoints title "crop 30",\
"< awk '{if ($75==$11) print $0}' t2" us 1:11 with lines points title "crop 20/30"
EDIT:
Хорошо, выше не будет работать, если вы хотите показать точки данных, которые имеют одинаковые данные в разных строках. Скрипт AWK будет более проработан. Я пробовал, как показано ниже, надеюсь, это поможет.
Вот тестовые данные.
0 0.0 0.0
1 0.3 0.6
2 1.6 1.6
3 0.3 1.5
4 0.6 3.6
5 0.3 4.3
6 0.3 0.7
7 5.5 5.5
8 6.6 6.6
9 5.2 5.2
10 8.3 8.3
11 2.7 5.0
12 2.8 8.3
13 3.3 2.8
14 7.9 3.9
15 9.9 7.9
16 15.3 15.3
17 14.7 14.7
18 3.8 18.1
19 18.1 12.1
И команда gnuplot (обратите внимание на очевидную разницу в обозначении столбцов):
plot 'test.dat' us 1:2 w lp title "1", \
'test.dat" us 1:3 w lp title "2", \
"< awk '{ind[NR]=$1; arr1[NR]=$2; arr2[NR]=$3} END{for (i=1; i<=NR; i++) {for (j=1; j<=NR; j++) {if (arr1[i]==arr2[j]) print ind[i], arr1[i]}}}' test.dat' test.dat" us 1:2 w lp title '1==2'
Итоговый участок:
![enter image description here](https://i.stack.imgur.com/vLsUd.png)