На самом деле Andengine поставляется с полным физическим расширением box2d, которое использует Box2D и является родным (быстрым).Я использовал его несколько раз, и он работает очень хорошо.
Вы можете проверить Andengine на http://www.Andengine.org
Edit: вам не нужно использовать andengine с расширением физики, еслиВы не хотите и можете просто использовать расширение, но вам нужно добавить свои собственные хуки.