Как установить значение в общих настройках?
Когда флажок установлен, вы делаете что-то вроде
preferences.edit().putBoolean(TheCheckedBoxId, true);
Если метод getBoolean () с общими предпочтениями всегда по умолчанию равен false, то либо значение вообще отсутствует, либо онопросто ложьЯ думаю, что вы можете попробовать
preferences.contains(findViewById(boxArray.get(i)).toString())
, чтобы увидеть, существует ли этот ключ вообще.Есть также метод Preferences.getAll ().