Да, вам нужно cd (сменить каталог) на «разархивированный каталог», и я предполагаю, что у вас нет команды PHP, доступной в оболочке, поэтому вам, вероятно, потребуется указать полный путь.*
из cmd.exe,
/path/to/your/php.exe ListFolders.php
или, если вы не хотите переходить в этот каталог, просто укажите полный путь
/path/to/your/php.exe /path/to/unzipped/ListFolders.php