AFAIK, вы не можете заставить приложения WINE выглядеть нативно на linux ни с QT, ни с GTK + (стандартные наборы инструментов для KDE и Gnome соответственно), поскольку WINE эмулирует Win32 GUI непосредственно для библиотек XServer, поэтому WINE не может "поговорите "с этими инструментами, но вы можете использовать цвета.
Посмотрите на эту ссылку , в ней есть инструкции о том, как получить цвета из вашей темы GTK в WineКонфигурация, удачи!