Я полагаю, что эти границы подпадают под "Аннотации" в Eclipse.Зайдите в «Окно» -> «Настройки» -> «Основные» -> «Редакторы» -> «Редакторы текста» -> «Аннотации» и найдите аннотацию, которая вас обидела.
Если тип аннотации «Вхождения» вызывает появление линий, можно либо снять флажок «Текст как», либо найти параметр «Отметить вхождение» и отключить его вообще.