Я не думаю, что можно изменить целевую папку в утилите развертывания, поскольку она может использоваться как для развертывания MSDB, так и для файловой системы. Это будет то, что вы указали в мастере развертывания после выбора развертывания SQL Server, но этот параметр не представлен.
После развертывания вы можете перемещать пакеты с помощью утилиты dtutil.exe, используя подкоманду / move
dtutil /Sources *serverName* /SQL *packageName* /move SQL;*folderName\packageName*
Поскольку вы также можете использовать его для копирования пакетов между файловой системой и хранилищем MSDB, DTutil предлагает альтернативный способ развертывания файлов.