В моем случае в качестве сервера БД используется Redmine 3.1.0 и MySQL.Я думаю, вы поймете основную идею в случае другой конфигурации.
DELETE FROM `enabled_modules` WHERE `name` = 'module_name_here';
INSERT INTO `enabled_modules`
(`project_id`, `name`)
SELECT
`id`, 'module_name_here'
FROM
`projects`
Вы можете активировать модуль для одного проекта, чтобы узнать его имя из enabled_modules.Или вы можете найти его в исходных кодах плагинов, он должен выглядеть следующим образом: 'project_module: module_name_here'
Пожалуйста, не делайте этого, если вы не до конца понимаете, что этоответ о!
PS: Да, я знаю - это грязное решение, но оно быстрое и достаточно простое для эксплуатации, которое необходимо раз в год или реже.