Используйте команду экспорта из меню конфигурации в Admin, и вы можете экспортировать в файл CSV.
Текущий экспорт немного запутан в том, что за элементами, имеющими несколько категорий, следуют строки, в которых есть только дополнительная категория.
Вы должны быть в состоянии сделать расширенный экспорт. Более сложным будет экспорт из MySQL. Сложно тем, что может быть несколько таблиц, которые создают полное описание продуктов.